Une greffe de cellules souches provenant d'un donneur compatible peut être apparentée (frère/sœur ou parent) ou non apparentée.
Les greffes provenant d'un donneur non apparenté compatible (MUD) sont souvent nécessaires lorsqu'aucun membre de la famille n'est disponible. Ces greffes consistent à prélever des cellules souches chez un donneur présentant une forte compatibilité génétique avec le receveur.